يعود إنشاء المعهد العالي للحضارة الإسلامية بجامعة الزيتونة في صيغته الحالية إلى الأمر الرئاسي عدد 865 لسنة 1995 المؤرخ في 8 ماي 1995 والقرار الصادر عن وزير التعليم العالي المؤرخ في 3 نوفمبر 1995 الذين بمقتضاهما :
- كان المعهد في صيغته القديمة يضطلع بالخصوص بتكوين الطلبة الأجانب في العلوم الإسلامية وتستغرق مدة الدراسة بالمعهد 4 سنوات متتالية تختم بالحصول على شهادة الأستاذية في العلوم الإسلامية ، ويمكن أن تسبق بسنة أو سنتين تمهيديتين لتعلم اللغة العربية للناطقين بغيرها ويتولى هذه المهمة أساتذة مختصون من معهد بورقيبة للغات الحية وذلك بالمعهد الأعلى للحضارة الإسلامية وتحت إشراف إدارته ، ويفتح المعهد أبواب التسجيل أمام الطلبة الراغبين في ذلك من جميع أنحاء العالم الإسلامي ومن غيره على أن تمر مطالب التسجيل بإدارة التعاون الدولي والعلاقات الخارجية بوزارة التعليم العالي التي تتولى البت فيها ويتراوح عدد الطلبة الذين يتابعون دراستهم بالمعهد في حدود200 طالب سنويا ينتمون إلى ما يزيد على 40 من الجنسيات والقوميات يتخرج منهم بمعدل 50 طالبا سنويا من حاملي الأستاذية في العلوم الإسلامية وفق الاختصاصات الثلاثة التالية :
الشريعة – أصول الدين – الحضارة الإسلامية – ويشرف على تكوين الطلبة وتأطيرهم ما لا يقل عن ثلاثين أستاذا من القارين والعرضيين.
ويقع المعهد بساحة معقل الزعيم بتونس العاصمة بمقر المدرسة التوفيقية سابقا حذو جامع الهواء ويحتوي على ثلاثة مدارج سفلية وأربع قاعات كائنة بالطابق العلوي متفاوتة المساحة وقاعة للأساتذة وقاعة مطالعة وعدة مكاتب ذات صبغة إدارية،كما تم إحداث قاعة خاصة لتدريس الإعلامية وتخصيص قاعة للانترنيت.
انطلق العمل بمنظومة " أمد" منذ السنة الجامعية 2007/2006
تتمثل إنجازات المعهد في: